Le nouvel hôte intermédiaire potentiel de la couronne du virus n'est pas le premier à pointer le doigt de blâme a été un pangolin!
2020 Février 7, South China Agricultural University a tenu une conférence de presse pour la pneumonie nouveau coronavirus recherche épidémiologique et les conditions technologiques. Sud Université agricole de Chine, Lingnan professeur de laboratoire de la science et de la technologie agricole moderne, la province du Guangdong, Chen Yongyi, Xiao Lihua et d'autres chercheurs de la réunion, a déclaré que le pangolin peut être un hôte intermédiaire potentiel nouvelle pneumonie couronne.
Le récent sommet Guan Yi virologue a dirigé l'étude, devenir pangolin est l'hôte intermédiaire pour prouver une autre --2020 le 18 Février, l'équipe avec l'Université de Hong Kong Guan Yi de l'Université médicale de Guangxi RETENUES équipe nommée « China Southern malais identification des pangolins asiatiques en 2019-ncov associée coronavirus « (identification de 2019-nCoV coronavirus lié à Malayan pangolins en Chine du sud) articles publiés dans le site de prépublication bioRxiv.
[Source: bioRxiv Propriétaire: bioRxiv]
Analyse et recherche de trois lots d'échantillons pangolin
En fait, chez tous les mammifères, le nombre de pangolin trafic illégal est le plus grand. Ils ont tous deux sont utilisés comme source de nourriture, il est également utilisé dans la médecine traditionnelle chinoise. Sur la Liste rouge UICN des espèces en voie de disparition, de nombreuses espèces de pangolin été identifiés comme étant en danger critique. Par conséquent, l'équipe enquête sur Guan de la contrebande de pangolins en.
Plus précisément, l'équipe de recherche de trois lots d'échantillons ont été analysés pangolin et la recherche (échantillon également inclus pangolin « médecine »).
premier , L'équipe a recueilli (poumon, de l'intestin, le sang) et d'autres échantillons de tissus 43 Août 2017 -2018 en Janvier Guangxi douanes ont saisi des opérations de lutte contre la contrebande dans 18 pangolins congelés.
ARN séquençage à haut débit, 43 échantillons en présence de six coronavirus: 2 dans les poumons, deux dans l'intestin, un mélange de poumon intestinal, est un sang.
Il est rapporté que l'utilisation de l'intestin - mélange d'échantillons du poumon, il est possible d'utiliser des lignées de cellules Vero-E6 isolé un nouveau genre betacoronavirus.
En même temps, lire la séquence de données, et pour combler l'écart par amplicons de séquençage, l'équipe a remporté six séquence complète du génome complet ou à proximité de l'analyse phylogénétique - comme représenté GX / P1E, GX / P2V, GX / P3B , GX / P4L, GX / P5E et GX / P5L-- ils appartiennent à la lignée 2019-Ncov (figure A). Ces virus ont Génomique et 2019-Ncov similaire, ayant neuf cadre de lecture ouvert prédit (fig. B).
ensuite L'équipe de recherche sur un nombre d'échantillons de pangolin entre mai-Juillet 2018 a été encore détection qPCR, a trouvé 12 de 19 échantillons de pangolin (neuf tissu intestinal, le tissu pulmonaire 10), les trois échantillons de tissu pulmonaire couronnées VIH-positifs. Par conséquent, en accord avec les échantillons de pangolins coronaires de deux lots de virus.
enfin , L'équipe Guan a contacté le centre technique des douanes de Guangzhou, qui a réexaminé leur saisie en Mars 2019 opération anti-contrebande dans cinq pangolins archive échantillons (contenant deux tampons de la peau, une organisation inconnue, un flocon), ces échantillons ont également trouvé un coronavirus.
Deux sous-types dans les échantillons de la nouvelle couronne de virus de coronavirus
Sur cette base, l'équipe de recherche est généré en comptabilité pour la séquence génomique partielle 86,3% de la longueur du génome viral, et en outre trouvé: génome coronavirus trouvée dans l'échantillon de pangolin, et ce nouveau coronavirus (SARS-CoV-2) du génome de taux similaire 85,5% -92,4%, la nouvelle couronne appartenant à deux sous-types du virus, l'un des domaines de liaison au récepteur (GD / P1L et GD / P2S) virus est étroitement liée à la nouvelle couronne.
Lei Feng réseau appris nouveau coronavirus genre Coronavirus appartenant à Sarbecovirus sous-genre et sous-genre premiers membres Sarbecovirus du coronavirus a subi une vaste recombinaison génétique.
Une analyse plus poussée des résultats a montré l'équipe Guan, bat coronavirus ZC45 et ZCS21 contient plus de SRAS-CoV lignées liées (régions génomiques 2,5,7) et les nouvelles lignées appartenant au virus de la Couronne (y compris le pangolin a trouvé un lignées de virus) génome fragment (région 1,3,4,6,8).
Mais plus important encore, l'équipe a observé le signal de recombinaison estimé entre pangolin coronavirus, bat coronavirus RaTG13 et les nouveaux virus de la couronne, en particulier la séquence d'acides aminés du nouveau domaine et la similitude des récepteurs Guangdong pangolin coronavirus liant le virus de la couronne jusqu'à 97,4% . Bien que le reste aminé de similitude acide de nouveau virus de la couronne la plus pertinente et la chauve-souris de coronavirus du génome viral, bat coronavirus RATG mais son domaine de liaison du récepteur de seulement 89,2%.
Pendant ce temps, dans le partage des acides aminés partageant Guangdong pangolin virus coronavirus et la nouvelle région de couronne du récepteur viral 5 résidus clés (section de boîte rouge ci-dessous), mais seul le nouveau virus de la chauve-souris de coronavirus partageant une couronne amino acide.
En outre, l'analyse phylogénétique montre que le Guangdong pangolin est pas un nouveau virus de la parenté plus proche de la couronne de coronavirus.
Par conséquent, bien que le courant ne peut pas donner une conclusion définitive, mais l'équipe de recherche émis l'hypothèse que les acides aminés entre Guangdong et la nouvelle couronne pangolin coronavirus similitudes virale peut être due à une évolution convergente, non provoquée par la restructuration, qui a également une preuve supplémentaire de l'animal hôte intermédiaire pour les humains le rôle des virus (qui brisera la précédente théorie du complot « virus artificiel »).
En plus des chauves-souris les seuls mammifères infectés par la nouvelle couronne de virus
Lei Feng réseau appris pangolin est jusqu'à présent les seuls mammifères infectés par le nouveau à l'extérieur de la couronne de virus, sauf les chauves-souris. Le coronavirus a trouvé deux lignées dans le pangolin et les lignées de virus de coronavirus sont liées à la nouvelle couronne, naturellement, il montre que les pangolins sont susceptibles d'être l'hôte de virus à long terme une nouvelle couronne.
Mais le document a également mentionné une autre possibilité - indépendant pangolin de la chauve-souris ou un autre animal hôte, a remporté la couronne du nouveau virus sur les virus. Et ce raisonnement dans une large mesure liée à l'origine du pangolin - pangolins ci-dessus, la plupart du temps à partir de l'échantillon de virus de la diversité de l'Asie du Sud-Est, le pangolin porté sans doute mystérieux.
En fait, comme le souligne l'équipe de recherche:
Coronavirus, y compris celles relatives au nouveau virus de virus de la couronne, de nombreux mammifères sauvages en Asie sont évidents.
Ainsi, pour la propagation pangolin de l'épidémiologie du virus, pathogénicité et transmissibilité des espèces infectieuses telles que la nécessité de poursuivre les recherches et les enquêtes. Mais il est indéniable que cette étude couronne une nouvelle fois les nouveaux hôtes du centre de recherche de virus ont indiqué la direction.
A propos de Guan
L'un de l'auteur correspondant du journal est Guan.
Lei Feng réseau [Note: Guan et son équipe, ce qui indique la source Baidu Encyclopédie]
En fait, Guan est un expert en microbiologie médicale, Membre étranger de l'École royale de médecine, Université de Hong Kong en Chongguang Ji Jin Xi (Virologie), les maladies virales émergentes Professeur de Hong Kong State University Laboratoire clé des maladies infectieuses émergentes directeur, directeur de la grippe du Centre de recherche de l'Université de Hong Kong, directeur de l'Institut conjoint de virologie, Université · Université de Hong Kong, Shantou, laboratoire commun Guangdong-Hong Kong du directeur des maladies infectieuses émergentes.
En 2003, l'équipe Guan premier à séparer le virus du SRAS, et a confirmé le SRAS chez les chats civette sont l'hôte intermédiaire, mais aussi une source directe d'infection humaine du SRAS, après lui et Académicien rapport Zhong Nanshan ensemble, civettes dans le Guangdong a commencé à dégager le marché, lutter efficacement contre l'épidémie de SRAS.
2017, en raison de la « prévention et le contrôle de l'infection humaine par la grippe aviaire H7N9 a grandi l'innovation et des avancées technologiques émergentes système de prévention et de contrôle des maladies infectieuses au nom de » Guan Yi et Li Lanjuan académiciens, haut-fu Académie des sciences, le professeur Yuen Kwok-yung qui, ensemble a remporté le État pour la science et la technologie prix progrès.
En 2020 cette épidémie qui fait rage au début de la (15 Janvier), Guan a déclaré dans une interview:
Coronavirus période d'incubation plus longue est de 15 jours, et depuis le 3 janvier jours, aucun nouveau cas de maladies infectieuses continent, vous pouvez déterminer l'épidémie a été maîtrisée. Pour le moment, les symptômes des patients ne sont pas graves, même si le successeur de quelqu'un, est également très limité. source d'infection claire, l'épidémie est sous contrôle, nous pouvons déjà voir l'aube de la victoire, je crois que les gens peuvent avoir une bonne année.
Cependant, en 2020 Janvier 23, il a dit Guan Yi a dit entretien Caixin:
Selon une estimation prudente, l'infection peut éventuellement échelle est 10 fois le décollage du SRAS. Je suis passé par beaucoup, jamais eu peur, la plupart peuvent être contrôlés, mais cette fois j'ai peur.
Sa remarque, a attaqué son Guan écrasante - de critiquer, à des attaques personnelles et les insultes.
Cependant, Guan Yi a mené une thèse, semble avoir prouvé: cette fois je n'ai pas peur.
références:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1.full.pdf
