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Pangolin est l'hôte intermédiaire? La nouvelle preuve est venue.
équipe Guan avec Guangxi Université médicale de Hong Kong APPRIS dernière équipe de recherche a révélé que: dans Plusieurs échantillons de contrebande pangolin , Et ils se trouvent dans le virus mortel 2019-nCoV très similaire à la coronavirus.
Il y a une semaine, South China Agricultural University ont les mêmes conclusions, il peut maintenant être dit avoir une preuve supplémentaire supplémentaire.
décrit également l'objectif des théories du complot ne volent pas « a fait l'homme-virus. »
Il convient de noter que les échantillons de tissus de pangolins, mais aussi du pangolin des douanes a saisi et retenu « médecine ».
Pourquoi identifier pangolin?
Ce nouveau document, actuellement publié dans la plate-forme prépublication medRxiv, des articles non évalués par des pairs, publiées et les conclusions sont les suivantes:
Nous avons trouvé dans la pluralité de pangolins de contrebande coronavirus, le domaine de liaison du récepteur de coronavirus (le RBD), et une nouvelle couronne de virus similitude de 97%. chauves-souris, le corps coronavirus par rapport coronavirus pangolin et la prévalence du nouveau virus humain plus proche de la couronne.
chercheurs Analyse et recherche Pangolin trois lots d'échantillons Cette conclusion provient.
La source de l'échantillon d'étude
Le premier échantillon Guangxi opérations de lutte contre la contrebande des douanes en Août 2017 pour la période Janvier 2018, un total de 43 tissu congelé de nombreux organes, y compris les poumons, les intestins et le sang, etc., de 18 pangolins.
Pour leur haut débit séquençage d'ARN a montré que la présence de coronavirus 6: 2 dans les poumons, deux dans l'intestin, le poumon - mélange intestin 1 dans le sang.
Comme on le voit ci-dessous, l'utilisation de l'intestin - échantillons pulmonaires mixtes en utilisant des cellules Vero-E6 peut être isolé d'une nouvelle ligne B coronavirus (Betacoronavirus).
Après le séquençage, les chercheurs ont obtenu six séquence complète du génome GX / P1E, GX / P2V, GX / P3B, GX / P4L, GX / P5E, GX / P5L, ils appartiennent tous à la lignée 2019-nCoV. En outre, ceux-ci trouve sur l'échantillon de pangolin congelé coronavirus et le virus 2019-nCoV a une structure génomique similaire.
Après la séquence génomique, des amorces ont été conçues pour la détection des chercheurs qPCR (méthode de détection d'acide nucléique de l'âme) peut être détecté un lot d'échantillons congelés contiennent le même paragraphe pangolin coronavirus.
Le second lot d'échantillons Au cours de mai 2018 pour la collecte Juillet, il est 12 pangolins 19 échantillons (9 tissu intestinal, le tissu pulmonaire 10), après le test qPCR, ils ont trouvé trois échantillons de tissu pulmonaire ont été positifs.
En d'autres termes, le deuxième lot de pangolin, pangolin et le premier lot de coronavirus est le même.
Le troisième lot d'échantillons Après la couronne est la nouvelle épidémie du virus, Guangdong nouveau examiné pangolin archivés cinq échantillons obtenus dans Mars 2019 de l'opération anti-contrebande, il contient deux tampons de la peau, une organisation inconnue, un pèse-personne.
séquençage à haut débit, les paillettes contenues dans l'échantillon peuvent être trouvées lectures coronavirus, à partir de laquelle des données peuvent être assemblées dans une partie de la séquence génomique de 21505 pb, environ 72% de la nouvelle génome viral de la couronne.
Il est intéressant de noter qu'une autre étude sur la prévalence de pangolin réalisée dans le Guangdong en 2019, également dans les échantillons pulmonaires ont trouvé une nouvelle couronne avec un groupe similaire de virus de virus.
Méthodes de recherche et conclusions
Sur la base de ces résultats, des équipes de recherche en utilisant les différentes méthodes de traitement et l'assemblage manuel, soit pour générer une séquence génomique partielle de la longueur de 86,3% du génome viral.
Après analyse, nous avons constaté que ces nouvelles similitude du génome pangolin coronavirus au nouveau virus de la Couronne est d'environ 85,5 à 92,4 pour cent, ce qui représente les deux arbres sous-système nouveau phylogénétique du virus de la couronne, l'un qui a une relation très étroite avec le nouveau virus coronal.
Il est intéressant de noter que supposé entre pangolin coronavirus, coronavirus de chauve-souris et le signal de recombinaison de coronavirus humain.
En particulier, le domaine de liaison au récepteur de coronavirus, et Guangdong Pangolins nouveau coronavirus Coronavirus présente une similarité de séquence élevée (97,4% de similarité amino acide), mais il est le plus étroitement lié au reste de la chauve-souris coronavirus génome viral.
Dans le domaine du récepteur de coronavirus, et coronavirus humain nouvelle couronne de virus de la chauve-souris seulement 89,2% d'acide aminé similitude.
En fait, les virus Guangdong pangolin coronavirus et nouvelle région couronne réceptrice virale 5 résidus clés (la boîte rouge) a le même acide aminé, mais seul le nouveau virus de la chauve-souris de coronavirus partageant une couronne acide aminé.
En d'autres termes, le corps du coronavirus pangolin Guangdong, et faire de nouvelles maladies humaines du virus de la couronne est très proche « des parents. »
Fait intéressant, la région de l'analyse phylogénétique d'affichage du site synonyme de système récepteur coronavirus séparé, cohérent avec le reste de la position phylogénétique de Guangdong système de collecte pangolin génome viral.
Ainsi, alors que les données actuelles est difficile de donner des conclusions définitives, mais les chercheurs spéculent, pourrait amino acide similitude entre le Guangdong pangolin coronavirus zone couronne réceptrice et le nouveau virus, il peut être la relation a évolué entre les deux virus, et recombinaison non génétique.
De plus, alors que sur les facteurs d'évolution convergente temporairement inconnue, mais elle a aussi mettre davantage en évidence le virus animal hôte intermédiaire est apparu chez l'homme dans le rôle.
Pangolin: Les chauves-souris externe uniquement des mammifères infectés
Jusqu'à présent, le pangolin est les seuls mammifères autres que les chauves-souris infectées par la nouvelle couronne de virus.
Remarquablement, nous avons trouvé deux lignées de coronavirus associés dans le pangolin, et ce à deux lignées CoV sont liés au nouveau virus de la couronne.
Cela donne à penser que ces animaux pourraient être un hôte de virus à long terme ces nouvelles couronne.
Mais nous ne pouvons pas exclure une autre possibilité - pangolin est indépendant de la chauve-souris ou un autre animal hôte, pour obtenir son nouveau virus associé à la couronne.
Il est également intéressant de noter que ces deux descente pangolin, sont tirés de la vente du pangolin Malayan, pangolin forte probabilité ce d'Asie du Sud-Est, mais aussi dans la croissance de la région pangolin, les gens de pangolin maintenu même connu sur la diversité des virus moins.
Il ne fait aucun doute que l'ampleur de la propagation du virus de populations pangolin nécessite une enquête plus approfondie, mais liée au nouveau virus de la couronne infection par le coronavirus récurrent dans le show du Guangxi et du Guangdong que l'animal peut être un hôte important potentiel apparaît coronavirus.
Enfin, l'équipe de recherche a également souligné que les coronavirus, y compris ceux qui sont liés au nouveau virus de virus de la couronne, de nombreux mammifères sauvages en Asie sont évidents.
Bien que l'épidémiologie de pangolin, pathogénicité et transmissibilité des espèces infectieuses reste à étudier, mais les données fournies ici suggère fortement que ces animaux ont besoin d'une manipulation très prudent, et exige l'interdiction stricte de la vente sur le marché.
L'étude a également souligné la direction pour la couronne plus d'étude nouvel hôte de virus peut en outre la surveillance de l'environnement naturel en Chine et en Asie du Sud, le pangolin, pangolin à comprendre le rôle des nouveaux apparaissent des virus zoonotiques de la Couronne et le risque de propagation à l'avenir.
De l'Université de Hong Kong et l'Université médicale du Guangxi
Enfin, re-introduit dans cette étude scientifiques dirigée.
Le premier est l'Université de Hong Kong côté. Responsable: Guan Yi, expert en microbiologie médicale, membre étranger de l'École royale de médecine, Université de Hong Kong professeur Chongguang Ji Jin Xi (Virologie), professeur de maladies virales émergentes, Université de Hong Kong Directeur de Laboratoire d'État clé des maladies infectieuses émergentes , directeur de la grippe du Centre de recherche de l'Université de Hong Kong, directeur de l'Institut conjoint de virologie, Université · Université de Hong Kong, Shantou, laboratoire commun Guangdong-Hong Kong du directeur des maladies infectieuses émergentes.
Depuis longtemps engagé dans la grippe et d'autres écologie de la recherche, l'évolution et la pathogenèse des virus respiratoires émergents, le virus du SRAS a été isolé et est l'un des premiers à proposer des scientifiques d'accueil du SRAS de la civette.
Après la nouvelle épidémie de virus de la Couronne, le 21 Janvier, Guan est allé au travail de première ligne réalisée pour trouver la source des animaux, mais a affirmé plus tard que « le marché de la Chine du Sud a été étanchéité de fruits de mer, et le lavage, la scène n'a pas fait. »
Guan également 23 Janvier prédit correctement la gravité de l'épidémie.
Un autre groupe principal de la recherche: APPRIS Guangxi Institut universitaire de médecine du génome de la vie Sciences directeur du laboratoire, le professeur. En 2009, il est diplômé de l'Université Jiaotong de Shanghai. Janvier 2014 à Avril ici à 2015 la visite d'étude à l'Université du Wisconsin-Milwaukee.
La principale direction de recherche est la biostatistique, la modélisation statistique du génome, la génomique, la bioinformatique statistique et l'extraction de données, la biologie moléculaire de la tumeur, et ainsi de suite. Ces dernières années, le concerné a publié plus de 60 articles, dont 50 papiers SCI.
Adresse Papers: https: //www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1.full.pdf
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