Si vous regardez attentivement les instructions de médecine, vous trouverez l'ingrédient actif est une molécule. Alors, comment trouvez-vous adapté au traitement d'une molécule de la maladie, il? Selon les scientifiques ont estimé qu'il ya environ 60 matière organique possible jusqu'à 10 fois la puissance, comment trouver des molécules médicamenteuses potentielles de devenir une myriade de molécules possibles, dans les sujets d'avant-garde d'aujourd'hui dans le domaine informatique. Superordinateurs peuvent simuler des molécules complexes in vivo processus biochimiques chez l'homme, puis sélectionnez promesse comme une drogue molécule, d'autres recherches et d'expérimentation.
Département américain des chercheurs Oak Ridge National Laboratory de l'énergie ont utilisé le plus puissant, le supercalculateur le plus intelligent pour le calcul du Sommet 77 types de petites molécules composés de médicaments du monde qui pourraient avoir besoin de nouvelles recherches pour lutter contre le SRAS-CoV-2 couronne virus pour les éclosions de maladies Covid-19. Les deux chercheurs sur le supercalculateur Sommet de plus de 8000 composés ont été simulés afin de sélectionner les plus susceptibles de composé coronavirus principal « pic » protéine de liaison, le rendant incapable d'infecter les cellules hôtes. Ils peuvent être utiles dans l'étude expérimentale du virus dans les composés d'intérêt ont été classés. Des chercheurs de l'ChemRxiv pré-publié leurs résultats.
US Department of supercalculateur Oak Ridge National Energy Laboratory Summit
L'idée est le point de départ d'intérêt coronavirus dans la cellule hôte produit à partir. Lorsque les chercheurs ont séquencé le virus, ils ont constaté que par un virus et le syndrome respiratoire aigu sévère infection (SRAS) chez l'homme le même mécanisme, la propagation du virus à 26 pays lors de l'épidémie de SRAS en 2003. Les deux virus structure similaire à promouvoir l'étude de nouveaux virus.
Directeur de l'Université de Tennessee State président et UT / ORNL Centre de Biophysique moléculaire Jeremy Smith (Jeremy C. Smith) sur l'hypothèse que les deux virus peut même être de la même manière « amarrage » aux cellules. Les membres du panel et UT / ORNL CMB chercheur post-doctoral Micholas Smith études antérieures du modèle basé sur la structure (également connue sous le nom de la protéine S) établie protéines pic coronavirus.
Les composés indiqués en gris, calculées à se lier avec le SARS-CoV-2 représenté sur la protéine de spicule cyan du sang humain et de prévenir les tensions indiquées dans le pourpre L'enzyme de conversion 2 récepteur ACE2 ou amarrage. Source: Micholas Smith / US Department of Oak Ridge National Laboratory Energy
« Nous pouvons être basée sur des informations récemment publiées dans la littérature du virus pour concevoir un modèle de calcul complet » Micholas Smith fait référence à une étude publiée dans la « science de la vie de la Chine ». Après le temps alloué calculé par la pleine allocation directeur Summit, Micholas Smith code de simulation chimique en utilisant une simulation de dynamique moléculaire est réalisée afin d'analyser le mouvement des particules et des atomes protéiques. Il a accosté pour simuler différentes protéine de spicule de composés de S, afin de déterminer si l'un quelconque d'entre eux peut être empêchée d'adhérer aux pointes des cellules humaines.
Micholas Smith a déclaré: «L'utilisation du Sommet, nous de ces composés ont été classés selon un ensemble de normes relatives à la possibilité de lier le pic de la protéine S avec eux » L'équipe a découvert 77 espèces de petits composés moléculaires, tels que les médicaments et les composés naturels, nous soupçonnons ces composés peuvent être utiles pour essai expérimental. Dans la simulation, ces composés se lient aux cellules humaines importantes dans la région de pointe, et peuvent interférer avec le processus d'infection. Après la sortie du modèle très précis de la protéine S dans la revue « Science », les plans de l'équipe de recherche pour utiliser la nouvelle version de la protéine S en cours d'exécution à nouveau la recherche informatique rapide, ce qui peut modifier le niveau peut être les produits chimiques les plus couramment utilisés. Les chercheurs ont souligné la nécessité d'essais expérimentaux de 77 composés, puis de déterminer sa disponibilité.
Département du laboratoire d'Oak Ridge Energy, a longtemps supercalculateur le plus rapide du monde
« Leadership Conference besoin d'obtenir rapidement des résultats de simulation nous avons besoin. Il nous a fallu un jour ou deux, mais sur un super-ordinateur ordinaire passer quelques mois », a déclaré Jeremy Smith. « Nos résultats ne signifient pas que nous avons trouvé une méthode de traitement du nouveau coronavirus. Cependant, nous avons beaucoup d'espoir que nos résultats fournissent une référence pour la recherche future, et fournissent un cadre pour une étude plus approfondie de ces composés en tant que personnel de laboratoire alors seulement que nous saurons si aucun d'entre eux ont les caractéristiques nécessaires pour atténuer le virus. « expérience doit être effectuée après le calcul. Jeremy Smith (Jeremy Smith) a déclaré que, en substance candidats de dépistage prometteurs de calcul étude expérimentale « highlight », qui, pour la vérification de certains produits chimiques peuvent lutter contre le virus est essentiel. Tels que l'utilisation des supercalculateurs comme le sommet est très important pour des résultats rapides. L'étude financée par le Programme de recherche et de développement dirigé laboratoire et utiliser les ressources de OLCF, installation utilisateur scientifique OLCF DOE situé au bureau de ORNL.
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