étude révèle Wuhan nouvelle infection par le coronavirus origine évolutive et le rôle des voies moléculaires humaines

2020 Janvier 21, Institut Pasteur de l'Académie des sciences de Shanghai chercheur Hao Pei , L'Institut national de prévention d'urgence médicale militaire et le contrôle des médicaments d'ingénierie Centre de recherche Wu Zhong Chercheur CAS Laboratoire clé de la biologie synthétique et moléculaire Plant Centre d'excellence Chercheur Li Xuan Coopération scientifique CHINE Sciences de la vie ( « China Science: Sciences de la vie « en anglais ), Publié en ligne intitulé " E volution du roman coronavirus de l'épidémie en cours Wuhan et la modélisation de ses protéines de pointe pour le risque de transmission humaine « Thèse.

Le document décrit l'analyse de l'évolution de la source de l'épidémie provoquée par la récente épidémie de pneumonie dans le roman coronavirus Wuhan, la cause et le 2002 Guangdong « SRAS » épidémie de coronavirus du SRAS, la relation entre l'évolution génétique « dans le syndrome respiratoire du Moyen-Orient » MERS coronavirus, et simulation de la structure par le calcul de la nouvelle protéine coronavirus Wuhan révèle nouveau coronavirus Wuhan spike- et la protéine ACE2 humaine et médie l'effet des humains infectent la voie moléculaire. Les résultats de l'évaluation du potentiel de la nouvelle infectivité du coronavirus humain Wuhan, fournissent une base scientifique pour la théorie a confirmé la source de l'infection et la transmission le plus tôt possible pour élaborer des stratégies de prévention et de contrôle efficaces.

Depuis Décembre 2019, Wuhan, Hubei concentrée pneumonie épidémique de cause inconnue est survenue. enquête épidémiologique a révélé que ce sont des cas de pneumonie a été trouvé dans la ville de Wuhan, « le marché de fruits de mer de Chine méridionale » associée. La ville de Wuhan, des moyens organisés d'une enquête de consultation d'experts multidisciplinaire, constate que l'utilisation d'essais expérimentaux dans épidémie de pneumonie Wuhan d'une pneumonie virale. 20208 Janvier au départ d'un nouveau coronavirus comme le déclenchement de l'agent pathogène.

La pneumonie virale flambée épidémique à Wuhan, Guangdong et en 2002 l'épidémie de « SRAS » Il y a beaucoup de similitudes, ont eu lieu en hiver, ont leurs origines dans la survenue initiale du contact humain avec en direct des transactions sur le marché des animaux d'origine animale, et sont faits coronavirus inconnu pathogènes cause. En date du 2018 Janvier territoire total de cas déclarés de pneumonie nouvelle infection par le coronavirus de la Chine dans 224 cas, dont 217 cas de cas confirmés (198 cas à Wuhan, Pékin cinq cas, la province du Guangdong, 14 cas), les cas suspects 7 cas (Sichuan deux cas de la province, un cas de la province du Yunnan, Shanghai deux cas, un cas de la région autonome Zhuang du Guangxi, province du Shandong, un cas). Le Japon a informé les cas confirmés dans 1 cas, 2 cas de cas confirmés notifiés Thaïlande, la Corée a notifié des cas confirmés dans 1 cas. Il y a 14 patients infectés par les travailleurs de la santé, l'émergence de nouveaux coronavirus de personne à personne et tend à se répandre.

202010 Janvier le premier roman génome coronavirus données de séquence Wuhan ont été libérés plus tard après l'autre plusieurs séquences génomiques isolées à partir du roman du patient communiqué de coronavirus. Ces nouvelles données du génome du coronavirus, de recherche et d'analyse pour la source de l'évolution de Wuhan nouveau coronavirus, pathologie des mécanismes pathogènes fournissent des informations de première main.

Afin de comprendre la relation entre l'infection roman coronavirus Wuhan chez les personnes connues deux coronavirus claires, les chercheurs de ce document par Wuhan nouveau génome du coronavirus en 2002, coronavirus du SRAS « SRAS », MERS « Moyen-Orient » Syndrome respiratoire coronavirus pangénomique virus comparaison et trouvé Il y avait une moyenne de ~ 70% et ~ 40% de similarité de séquence . Ce qui est pas Coronavirus avec le gène de touches de fonction cellule hôte de pointe (codant pour une protéine S-), des différences plus importantes .

Pour analyser le roman source coronavirus évolution Wuhan et de la nature possible de l'hôte, les chercheurs ont utilisé nouveau coronavirus Wuhan et recueilli beaucoup d'analyse de l'évolution génétique des données. Wuhan a constaté que nouveau coronavirus appartenant Beta coronavirus (Betacoronavirus) . Betacoronavirus est un virus à ARN brin positif simple brin enveloppé de protéines, les infections parasitaires et les animaux supérieurs (y compris les humains). Dans la position sur l'arbre de l'évolution, avec le SRAS (menant à 2002, « SRAS ») et le virus du SRAS comme virus (semblable au SRAS) groupes voisins, mais ne appartiennent au virus du SRAS SRAS et des groupes de classe. Il est intéressant qu'ils ont évolué sur le exogroupe est un parasite commun sur roussette HKU9-1 coronavirus. si Wuhan coronavirus et l'ancêtre commun du SRAS / classe coronavirus du SRAS est HKU9-1 et des virus similaires. Parce que les voisins de l'évolution et exogroupe Wuhan coronavirus trouvé dans il y a toutes sortes de chauves-souris, Wuhan spéculé hôte naturel coronavirus pourrait aussi être une chauve-souris . Comme résultat en 2002, « SRAS », comme le coronavirus du SRAS, Wuhan il peut être coronavirus inconnu est l'hôte intermédiaire des médias dans le processus d'infection des chauves-souris à l'homme en .

Depuis nouveau coronavirus Wuhan et 2002 virus du SRAS « SRAS » et le « Moyen-Orient syndrome respiratoire » virus MERS a une grande distance génétique, de sorte que les auteurs du roman infection par le coronavirus dans les gens et les mécanismes Wuhan voies sont analysés. virus du SRAS S- protéines du virus MERS et la protéine S, respectivement, par l'interaction de liaison aux protéines ACE2 humaine ou d'une protéine DPP4 pour infecter les cellules épithéliales des voies respiratoires humaines. L'auteur a d'abord comparé le récepteur hôte Wuhan coronavirus et le SRAS et le virus MERS région d'interaction de la protéine S (zone RBD), qui se trouve dans la zone RBD, Wuhan coronavirus et le virus du SRAS est tout à fait similaire, mais avec un virus big MERS différence, donc exclu la possibilité S- et DPP4 interaction des protéines pour infecter les humains. Cependant, Wuhan coronavirus S et l'interaction de la protéine ACE2 humaine, il est très difficile - virus du SRAS prouvé S- ACE2 interaction des protéines avec les cinq acides aminés clés, il y a quatre changé à Wuhan coronavirus.

Afin d'analyser clairement le problème, l'auteur de l'article en utilisant la méthode de calcul de la simulation de la structure moléculaire, Wuhan coronavirus S- protéine ACE2 humaine et des études de structure des protéines d'amarrage, a obtenu des résultats surprenants. Bien que Wuhan coronavirus protéines S- lié à la protéine ACE25 a quatre changements clés amino acides, mais après les acides changements acides, mais la protéine du virus du SRAS global maintenu parfait S et l'interaction de la protéine ACE2 conformation structurale primaire . Bien que le nouveau coronavirus Wuhan nouvelle structure et ACE2 capacité d'interaction des protéines, en raison de la perte d'un petit nombre de liaisons hydrogène a diminué (par rapport à une protéine du virus du SRAS effet à la baisse de S- et ACE2), mais obtenir encore une forte énergie libre de liaison ( -50,6 kcal / mol). Ce résultat suggère que Wuhan coronavirus est le mécanisme moléculaire par S- et les interactions entre protéines humaines ECA2, et d'infecter les cellules humaines épithéliales des voies aériennes. la recherche Wuhan prédit la capacité des personnes infectées par le coronavirus, la prévention et le contrôle scientifique, de développer des stratégies de prévention et de contrôle et la mise au point de techniques de détection / intervention a jeté les bases de la théorie scientifique.

Les résultats de la recherche, avec le soutien des grands enjeux scientifiques et de la technologie « importante découverte de médicaments » État (recherche médicale et pharmaceutique d'urgence et le développement de nouvelles variétés du système clés innovations), l'Institut Pasteur de l'Académie des sciences de Shanghai, Académie nationale d'urgence médicale militaire la prévention et le contrôle des drogues et de l'Académie chinoise du Centre de recherche pour l'ingénierie moléculaire végétale Centre d'excellence pour le laboratoire de recherche coopérative de la biologie synthétique terminée. L'étude a également été soutenue par la Fondation nationale des sciences naturelles de la Chine et de l'Académie chinoise des sciences plan stratégique des ressources biologiques « des ressources biologiques dérivées Library » projet. XU Xin Tian, Chen Ping, Wang Jing Fang sont les auteurs de co-première.

Source: le magazine en Chine la science

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