18 minutes pour compléter 400G (55x) toute analyse du génome humain et l'avenir « BT + IT » puissance de soins de santé de précision

[Réseau nuage chasse (micro lettre: ilieyun) Pékin] Juillet 27 Rapport (texte / Turbuhaler Jie)

Un corps adulte environ 1014 cellules ont le même --DNA matériel génétique, le gène est un fragment fonctionnel de l'ADN, est les facteurs internes les plus importants pour la santé humaine, mais aussi les différences fondamentales entre les personnes. L'analyse des résultats de tests génétiques, non seulement peut être utilisé pour le dépistage précis et le diagnostic des maladies génétiques et les maladies des mutations somatiques, il peut également être combiné avec le style de vie, les médicaments, les antécédents médicaux, et d'autres facteurs environnementaux sur l'intervention de la santé humaine et des conseils personnalisés.

Le Sommet 2017AWS la technologie a tenu récemment, le réseau de nuage de chasse (micro lettre: ilieyun) entrent en contact avec les gens et l'avenir de la biotechnologie Co., Ltd (abréviation: les gens et l'avenir), fondée en 2014, est basée à Pékin, Changsha et Hangzhou chaque il y a des branches, et le développement futur de leur propre séquençage des gènes et la plate-forme technologique d'analyse génétique, est une utilisation de solutions la technologie génétique (BT) et de la technologie de l'information (TI) pour l'industrie de la santé médicale exactes et précises entreprises nationales technologie de haute.

Étant donné que c'est une technologie génétique et de la profondeur technique inter-entreprises, il a été, de la logique extérieure de l'entreprise est la technologie du son, co-fondateur et directeur technique chanson Zhuo a dit dans une interview: « Il y a encore toute la gestion de la santé cette dimension est manquante, le gène que nous voulons rejoindre cette dimension pour aider les gens à atteindre la gestion de la santé précise, ce qui est la tendance de développement de l'industrie des soins de santé dans son ensemble national et étranger, d'autre part l'industrie du séquençage des gènes fait maintenant face à un grand point de la douleur est la croissance explosive des données génétiques , l'industrie devrait les données génétiques en 2017, le pays sera plus 100Pb, mais ces données à grande échelle, la transmission de données à stocker, l'interprétation calculate pose un test sévère, et nous sommes en tant que société BT + IT ont également la capacité technique, nous espérons également fournir un plus adapté à nos solutions informatiques de l'industrie pour l'ensemble de l'industrie ».

Il est entendu, et l'avenir de l'équipe fondatrice dès 2009 à San Diego a lancé une étude sur la traduction clinique des tests génétiques, et l'équipe grâce à la recherche sur le marché, les tests génétiques lorsque la Chine a fait face au dilemme de la connaissance du marché est trop faible, il a fait des provisions techniques jusqu'en 2014, il a été entreprise constituée en société. Chanson Zhuo a dit: pour l'industrie du séquençage des gènes, il est important d'obtenir un échantillon, obtenir des échantillons à l'étranger pour divers contrôle de la vitesse est relativement lente, mais actuellement dans le pays, une bonne technologie et la commodité d'obtenir un échantillon, ce qui permet le gène en chinois séquençage cette route, rattraper son retard à l'étranger dans une très courte période de temps encore plus qu'à l'étranger.

l'innovation de séquençage de gènes pour apporter de nouvelles applications industrielles

À l'heure actuelle dans le domaine de la santé, et l'avenir grâce à sa gamme complète de produits de services de tests génétiques de qualité des clients d'affaires, en plus à l'hôpital clinique et l'avenir développer des services de dépistage à l'assurance, les canaux médicaux et de gestion de la santé. Chanson Zhuo a dit: « Le test génétique est la première étape, le suivi devrait avoir l'intervention appropriée, des mesures d'éducation et de gestion universelles forment du moniteur à l'intervention de la boucle de soins de santé précis. »

Et la direction future de l'entreprise est globalement divisé en trois sections: gestion de la santé, les diagnostics cliniques et grandes analyse de données.

gestion de la santé, grâce à la détection et l'interprétation du génome humain, il est possible de fournir différents types de services de prévention, d'élaborer un programme personnalisé de gestion de la santé. Il a maintenant un service d'évaluation des risques génétiques sensibles, l'utilisation des tests génétiques, afin d'évaluer le risque de chaque utilisateur par la maladie génétique, les données de signes, style de vie, et les programmes de gestion de la santé et fournit la médecine personnalisée exclusive et d'autres moyens d'intervention, le cancer précoce criblage, seulement 10 ml de sang périphérique dessinée par la précision de détection moléculaire, pour obtenir le dépistage non invasif en toute sécurité et à la prévention précoce de la tumeur, la flore intestinale détectée, en utilisant la deuxième génération à haut débit séquençage, l'analyse de la santé de l'intestin de l'individu, précisée les programmes d'intervention.

Et pour les besoins cliniques, avec des tests génétiques complets et la capacité d'interprétation de la génétique médicale, les troubles chromosomiques peuvent le nouveau-né maladie génétique, le cancer et le traitement personnalisé pour le ftus, de la biologie moléculaire pour résoudre les niveaux les stratégies proposées pour atteindre médical précis. En termes de biopsies tumorales liquides, et la prochaine recherche indépendante ctBEST technologie, la sensibilité de détection de 0,01%. le dépistage prénatal non invasif en utilisant des techniques de détection de mutation VLF, par échantillon de sang périphérique mère du ftus en présence de séquençage de l'ADN libre peut déterminer si le ftus vers le bas, le syndrome d'Edward, le taux de précision de 99,5%.

. Par-dessus tout appartiennent à l'application spécifique et l'avenir de la recherche indépendante et le développement de solutions de séquençage et de la bio-informatique NGS ont été réalisables De plus, les gens qui viennent dans le domaine des tests génétiques ont également reçu beaucoup de qualification officielle, tels que: centre de démonstration des technologies de test génétique national, information génétique grande technologie d'application de données Engineering Research Center de la province du Hunan, les unités nationales pilotes séquençage des gènes à haut débit, etc., Xiangya école de médecine et en même temps, la société a une relation de travail étroite.

secteur BT pour la solution IT

En plus de R & réalisations D dans le domaine de BT, pour le statut spécial de développement et les goulets d'étranglement industrie BT, et l'avenir a été créé au début de 2014 pour prendre en compte un problème, stockage compressé soins de santé de grande transmission de données et de puissance de calcul sera un impact sur l'ensemble de l'industrie contraintes pour l'efficacité du développement. Avec l'application des tests génétiques plus largement, le coût du séquençage des gènes est d'amener les gens à faible revenu et inférieur de plus en plus, ce qui les données génétiques échelle tendance de croissance explosive. Avec le dernier séquenceur Novaseq produit d'Illumina, par exemple, à pleine capacité à produire le débit de données de 6TB / 30 h, compte tenu de la taille du fichier de données de séquençage du génome d'une personne est d'environ 200 Go, ce qui signifie que la production par heure équivaut à une machine Les données de séquençage du génome humain.

À l'heure actuelle, une seule analyse du génome humain de calcul de données de 200 Go prend 30 heures, de sorte que l'analyse des données et la vitesse de calcul pour faire face à la flambée des grandes tendances des données, l'analyse des données, le résultat serait suivre le taux de production, ce qui entraîne l'accumulation de grandes quantités de données.

Informations sur les données génétiques a produit deux gros points de la douleur de l'industrie: 1. Calculez le coût lent, élevé, 2, gros volumes de données, transmission difficile.

Et l'avenir reposant sur AWS plate-forme cloud de calcul pour la construction du système d'accélération des nuages aux nouvelles technologies de distribution de données, la technologie brassage des données, par le développement de haute performance base de données distribuée StageDB, combinée à la connaissance du génome, il est possible de calculer 18 minutes pour compléter le génome humain 400 tâches d'analyse GB (55x) de données, les performances de calcul et de calculer la relation entre l'échelle des ressources semblables à la relation linéaire idéale entre les coûts calculés seulement une centaine de yuans, en hausse de 99,9% de précision des résultats analytiques.

Chanson Zhuo Jieshao: « La mise en uvre de cette technologie est équivalente à d'abord joué trois batailles, à grande vitesse distribuée à 250 serveurs AWS EC2 pour les grandes données et l'équilibre des besoins futurs en fonction des caractéristiques génomiques et biologiques de données informatiques de haute performance. mis au point une technique de segmentation de données unique grande, à l'origine compressé à 66 minutes pour compléter la tâche en 1 minute, de sorte que le temps de calcul est réduit à des tâches d'analyse toute 3-4 heures. seconde bataille, nos chercheurs utilisant des objets AWS S3 stockage de programme, une des techniques de réarrangement des données développées, pour couper séparé des fichiers de données massives réarrangés pour obtenir le fragment d'ADN complète 109 à moins de 20 à 25 minutes disposés dans une position sur le génome de la tâche, l'ensemble de compression de temps de calcul dans les 60 minutes dans le stockage de données d'autres recherches, nous avons mis au point un ensemble de base de données valeur-clé StageDB de haut niveau, de sorte que le temps de l'étape de réarrangement de données diminue à 40 secondes, pour raccourcir la durée totale de 18 minutes. "

En termes d'accélération matérielle, et l'avenir de la conception indépendante et le développement de l'analyse des données génétiques de la carte accélérateur matériel FPGA, l'analyse des données et construire un ordinateur spécifique à gène GTX-One. 30X pour compléter les alignements simples et l'analyse du génome mutant dans les 15 minutes.

De plus, l'avenir et le développement d'un grand ensemble de compression de données génétiques, le stockage, la transmission de la bande passante complète, la distribution des données trois fonctions principales d'une solution GTX.Zip, l'efficacité de compression ultra-élevé de données génétiques pour obtenir un coût de stockage de diminution substantielle de transmission de données compressées, la transmission à pleine charge, les caractéristiques de bord de côté d'émission de compression tels que le transfert de gènes et la distribution de grandes quantités de données qu'il fournit un programme opérationnel efficaces autres que le disque dur est envoyé. Chanson Zhuo prédit: « Les coûts de séquençage génétique ont diminué de plus de Moore, en 2000, quand, coût de séquençage des gènes jusqu'à 3 milliards $, et grâce à la technologie innovante de itérative 2019, le séquençage génétique devrait coûter 100 $ pour contrôler le niveau de , il peut devenir une sorte de service universel. "

Et l'avenir de l'équipe fondatrice est relativement unique, avec son propre capital, la technologie et le marché attribue triple bénédiction, et très discret PDG, a reçu presque pas d'entrevues aux médias. Il est entendu que le fondateur de l'entreprise et chef de la direction Yuan Meng Xi est titulaire d'un double baccalauréat en économie financière Pennsylvania State University, MBA de l'Université Cornell, a travaillé chez Goldman Sachs, la Banque mondiale, le capital IDG et d'autres institutions financières, co-fondateur et directeur technique chanson Zhuo Ph.D., est diplômé de l'Université Vanderbilt, direction de la recherche pour la génétique humaine et la bio-informatique avec les disciplines biologiques et informatiques Intersection. Co-fondateur et directeur de l'exploitation Huang Wenjing détient un baccalauréat en commerce international et la gestion stratégique, maîtrise, diplôme de MBA de l'Université Cornell, l'Université du Zhejiang, a travaillé en tant que gestionnaire de compte chez P & G, ainsi que des stratégies d'innovation médicale mobile dans Eli Lilly est responsable de la planification stratégique et de la marque d'entreprise la mise en uvre.

À l'heure actuelle, l'avenir et l'équipe emploie près de 300 personnes, y compris les centres techniques autour de Changsha, l'équipe technique de 90 personnes, principalement responsable du développement technologique et la transformation des produits, Song Zhuo dit que la compagnie a été établie, nous avons reçu des milliers d'investisseurs providentiels dix mille yuans soutien en capital, et la société dans sa première année pour atteindre la rentabilité.

Produit: BT + solutions technologiques informatiques

Société: biotechnologie Co., Ltd et l'avenir

URL: http: //www.genetalks.com/index.html

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